沒有進入排名可能意味著有些大學被外國博士生、“世界級”科學家、學術伙伴和慈善家所忽視，例如：

大學排名時，所列入的標準和數據，最易于反映生物科學的研究成果。相對于社會科學范圍內的建筑、創意、人文和美術則不易反映其研究成果。諸如工程、商業和教育等專業學科，向來沒有悠久的同行評議、不以名師出高徒為傳統，也不易反映出對社會發展的重要貢獻和真正實力。

排名起初有重視校友社經地位、畢業后貢獻和學術聲譽的傾向，其中擁有歷史悠久和資金充裕的學府，通常是偏向發達國家中的醫學院。這種排名標準使發展中國家的大學無法與歐美的重點大學在同一個起跑點上競爭。再者菁英教育和大眾教育之間的差別，以及發達國家和發展中國家大學之間的鴻溝也可能會擴大他們的優劣勢。

有一個特別的問題是，排名使某一時刻的品質與定義會留下一種固定的印象;而高等教育機構的使命是多樣化的，所以僅僅把重點放在科學研究的實力上，會忽略了其他的維度，諸如教學、社區參與、第三職能、創新性，以及社會和經濟影響。

高等教育機構是復雜的組織，不同的院系和活動皆有不同的優勢和弱點。根據所使用的標準和指標/權重的不同，對優秀程度的定義也可能變化。由于排名計算總分，使高等教育的復雜性被減少至一種具有意義的數據上，而差別被夸大了。

盡管存在這些批評，俄羅斯、中國大陸、臺灣、印度、日本、韓國、歐洲各國政府仍然非常努力于建立自己的世界級大學。